Program do analizy potencjału leczniczego cząsteczek

Szacuje się, że we Wszechświecie występuje 10^60 struktur chemicznych. Wiele z tych struktur może okazać się przydatnych w tworzeniu nowych materiałów oraz nowych środków leczniczych.

Naukowcy z Pittsburga opracowali specjalny algorytm komputerowy, służący mapowaniu nowo odkrytych molekuł, które w budowie zawierają atomy węgla. Powstała „mapa" molekuł ma pomóc chemikom w szybszym i tańszym syntetyzowaniu nowych związków chemicznych. Istnieje już cyfrowa biblioteka, w której zgromadzono około miliard odkrytych cząsteczek. Jednak zgromadzone w bibliotece cząsteczki charakteryzują się zbliżoną strukturą. Według Dawida Beratana, który zajmuje się poszukiwaniem nowych cząsteczek – jest jeszcze wiele do odkrycia.

W celu ulepszenia dalszych poszukiwań różnorodnych molekuł, opracowano specjalny algorytm, który pozwolił zgromadzić 9 milionów cząsteczek z różnych regionów „Wszechświata cząsteczek". Algorytm opiera się na prostym pomyśle dokonywania zmian w prostych cząsteczkach, np. poprzez dodawanie atomu węgla lub zmianę wiązania z pojedynczego na podwójne, i tak dalej. W ten sposób można według Aarona Virshupa - twórcy algorytmu - wyszukać każdą cząsteczkę. Virshup wysłał swoje pierwsze odkrycia do chemików, którzy weryfikowali nowe cząsteczki pod względem realności występowania, a także ich stabilności. Po otrzymaniu uwag ulepszył swój program i w efekcie otrzymał wcześniej wspomniane 9 milionów zmapowanych cząsteczek, które mogą być wykorzystane przez chemików.

Program jest dostępny w formie on-line, co umożliwia jego wykorzystanie przez wielu naukowców, którzy chcą dokonywać nowych odkryć i syntetyzować związki z jeszcze niepoznanych regionów „molekularnego Wszechświata".

(pj)