Metoda analizy modyfikacji białek oparta na spektrometrii masowej

Potencjalne miejsca fosforylacji /Źródło:Helmholtz Zentrum München

Naukowcy z Niemiec opracowali metodę analizy modyfikacji białek. Metoda polega ma odwzorowaniu miejsc fosforylacji polimerazy RNA II – enzymu, który jest odpowiedzialny za ekspresję genów.

Polimeraza RNA II przepisuje informację genetyczną i epigenetyczną z DNA na RNA. Jej działanie można porównać do głowicy odczytującej zapis taśmy magnetofonowej.. Uruchamiająca działanie polimerazy, fosforylacja możliwa jest w 240 różnych jej miejscach. Badaczom z Monachium i Getyngi udało się odkryć metodę na jednoczesne rozpatrywanie wszystkich 240 miejsc. Ideą metody jest połączenie genetyki oraz spektrometrii masowej. Tworzone modyfikacje wariantów określonych regionów fosforylacji badane są w fazie gazowej, gdzie występuje pole elektryczne. Przyspieszenie znajdujących się w polu ładunków sprawia, że każdą zmodyfikowaną cząsteczkę ze względu na inną masę, charakteryzuje inny czas „lotu". W ten sposób możliwe jest identyfikowanie poszczególnych modyfikacji oraz specyficznych czynników uczestniczących w fosforylacji polimerazy. Naukowcy z sukcesem porównali zmodyfikowane wzorce polimerazy RNA II u ludzi i drożdży.

Jak zaznaczają autorzy badań nad opisaną metodą, regulacja transkrypcji genów przez polimerazę RNA II to podstawowy proces regulacji działania komórek. Wszelkie zaburzenia tego procesu wpływają na niewłaściwe działanie komórek. Badanie mechanizmu fosforylacji, zachodzących w określonym momencie cyklu transkrypcji jest konieczne, aby zrozumieć procesy regulacji ekspresji genów odpowiedzialnych za powstawanie chorób.

(pj)