Genomika będzie generować ogromne ilości danych

Genomika będzie generować ogromne ilości danych

Eksperci z amerykańskiego Cold Spring Harbour Laboratory twierdzą, że genomika zaczyna generować coraz więcej danych. Wkrótce ich ilość może przekroczyć 100 petabajtów na rok. To tyle, ile obecnie generuje YouTube. W tej chwili co 7 miesięcy podwaja się ilość danych generowanych z genów.

Genomika to dziedzina genetyki molekularnej, zajmująca się odczytywaniem genomów organizmów (sekwencjonowaniem) i poznawaniem sekwencji nukleotydów w konkretnych genach. W ramach genomiki bada się również zależności pomiędzy strukturą genu a jego biologiczną funkcją w organizmie.

Obecnie dużym wyzwaniem jest opracowanie wydajnych metod zbierania, przechowywania, przetwarzania i interpretowania informacji zapisanej w genach, która coraz szybciej staje się zbiorem zer i jedynek. Michael Schatz, associate professor, pracujący w Simons Center for Quantitative Biology, będącym częścią Cold Spring Laboratory, zwraca uwagę, że w kolejnych latach zamiast mówić na coś ogromnego, że występuje w astronomicznych ilościach, będziemy używać zwrotu „w genomicznych ilościach". Gdyby całą informację genetyczną o człowieku, którą dotychczas pozyskaliśmy, zgromadzić w jednym miejscu – jest to ok. 250 tys. sekwencji, to zajęłaby ona 25 petabajtow (co odpowiada 25 000 terabajtów).

Schatz szacuje, że do 2025 roku ok. miliard ludzi będzie miało zsekwencjonowany swój genom. Jeśli te dane zaczną być przetwarzane w celu poznania, np. skłonności do pewnych chorób, stworzy to duży problem w zarządzaniu danymi. Dodatkowo, gdy zaczniemy genomy porównywać ze sobą w różnych płaszczyznach, to problem się dodatkowo pogłębi. W związku z tym naukowcy zajmujący się przetwarzaniem danych już dzisiaj muszą się przygotować na kolejną rewolucję informatyczną.

(pj)